对于“双通道”品种带来的客流，理论上可以通过关联销售挖掘其潜在健康需求，通过关联品销售带来的利润，缓解因“双通道”品种毛利低、投入大给药店带来的压力。但在实际操作中，这一做法目前面临着三大难点。2022年1月，云南省医疗保障局、云南省卫生健康委员会、云南省药品监督管理局联合发布《关于建立完善国家医保谈判药品“双通道”管理机制的通知》，明确表示：“双通道”药店应严格按药品分类管理的要求销售药品，不得以任何形式变相向患者推销其他药品、医疗器械、保健品、食品、消毒产品、化妆品等，切实保障患者权益和用药安全。虽然目前只有云南省对“双通道”药店提出明确的“限售”要求，但不排除后续还有省份跟进。国药控股国大药房有限公司健康管理部部长李志平认为，药物之间会有相互作用，而“双通道”药品的服用者很多是肿瘤病人，体质敏感脆弱，饮食要求与普通人群都不一样，对于合并症的用药要求则会更高，如果向他们推荐关联药品，风险非常大，一定要慎重。比如，对于合并有糖尿病的肿瘤患者推荐正常人群使用的降糖药，一般情况下可能不会有问题，但万一出现低血糖等异常现象，则很难界定是推荐的药物引起的还是其他原因造成的。

合肥苏祥大药房副总经理王燕认为，很多“双通道”品种的使用者久病成医，患者和家属在疾病治疗、营养学等方面的专业知识甚至比一些药店店员还要丰富，关联销售方案要获得他们的认可有一定的难度，一方面需要在选品方面下功夫，保健品或特医食品等营养支持类产品可能更合适；另一方面，需要药店的员工有足够的专业知识储备，能够通过专业解答赢得患者及家属的信任。

正是因为考虑到潜在的种种风险及操作难度，一些有“双通道”资质的专业DTP药房只经营DTP品种、“双通道”品种。在合肥苏祥大药房，非DTP品种的占比仅1%。在江苏德轩堂的门店一角，虽然陈列着少量非DTP品种，却不是为了销售，而是因为监管部门要求当地药店经营的品种要达到一定的数量，对于这些品种，店员从不推荐，公司也没有任何销售指标考核。